1 Oct 1906 - 30 Sep 1907 Affectation sur la canonnière  SMS Aegir
1 Oct 1907 - 30 Sep 1909 Officier de Compagnie à la I.Torpedo-Division où il occupe plusieurs postes d'Officier de Quart sur diverses unités avant sa promotion au grade de Oberleutnant zur See le 27.3.1909
- T-Boot S 141 (3.1.1908 au 10.6.1908)
- T-Boot S 148 (30.8.1904 au 14.9.1908)
- T-Boot G 133 (5.4.1909 au 10.6.1909)
- T-Boot  G 133 (15.8.1909 au 6.9.1909)
1.10.1909 au 30.9.1911 Officier de compagnie au Mine-Bataillon où il commande successivement les torpilleurs :
- T-Boot  S 46 (1.11.1909 au 2.12.1909)
- T-Boot  S 56 (27.6.1910 au 10.9.1910)
- T-Boot  S 35 (27.9.1910 au 28.9.1910)
- T-Boot  S 35 (24.10.1910 au 17.12.1910)
- T-Boot  T 55 (3.9.1911 au 27.5.1911)
- T-Boot  T 55 (21.8.1911 au 15.9.1911)
1 Oct 1911 Départ pour Tsingtao (Chine) où il arrive le 22 Nov.
23 Nov 1911 - 1 Dec 1913 Officier de Quart sur le cuirassé SMS Scharnhorst

A partir du 7.1.1916, au Chantier Blohm & Voss de Hamburg pour suivre l'achèvement du sous-marin mouilleur de mines U 72 dont il prend ensuite le commandement
26 Jan 1916 - 5 Jul 1917 Commandant de l‘U 72. Après une période de mise au point, il entre en service opérationnel le 11.4 au sein de la I.Halbe Flottille de la Hochseeflotte, effectue une première mission de minage fin juin puis le sous-marin met le cap sur la Méditerranée le 20.8, contourne l'Ecosse et entre à Cattaro le 17.9 après avoir procédé à des mouillages de mines devant Oran qui feront les premières victimes de l'U 72.  Au cours de cette affectation, Ernst Krafft effectue 5 patrouilles de guerre et coule 15 navires avant de passer son commandement.
26 Jul 1917 - 15 Sep 1918 Commandant de l‘UB 51. Il prend le commandement de ce sous-marin à Kiel d'où, le 18.9 après la période de mise en service il met le cap sur la Méditerranée, arrivant à Cattaro le 19 octobre ayant coulé 3 navires durant la traversée. Krafft effectue 5 patrouilles avec cette unité, ajoutant 17 navires à son palmarès. A la mi-août, il conduit le bateau au chantier de Pola puis rentre en Allemagne. En 10 patrouilles de guerre, il a coulé 37 navires pour 80500 tonnes et en a endommagé 5 totalisant près de 22000 tonnes.

24 Sep 1918 - 11 Nov 1918 A disposition de la commission d'acceptation des sous-marins neufs (U.A.K) 
26 Dec 1918 - 31 Jul 1919 Pendant la guerre civile, il est au 1er Régiment de Courlande
Reichsmarine
1 Sep 1919 - 28 Mar 1920, Chef du bureau du personnel de la station navale de la Baltique puis Officier de compagnie du IV.Bataillon de Défense Côtière jusqu'au 4 Nov 1920)
5 Nov 1920 - 15 Mai 1921 Officier de compagnie du III.Bataillon de Défense Côtière
16 Mai 1921 - 31 Jul 1921 Détachement auprès du Commandement Naval
1 Août 1921 - 31 Mars 1924 Instructeur Navigation à voile à l'Ecole Navale de Mürwik. Dans ce poste il est promu Korvettenkapitän le 1 Jan 1923 et prendra en deux occasions le commandement de l'aviso Niobé gréé en voilier du 15 Mar 1922 au 10 Août puis du 23 Mar 1923 au 30 Sept.
1 Avr 1924 - 28 May 1924 A disposition du Commandement de la Base Navale de la mer du Nord (Wilhelmshaven).
29 Mai 1924 - 30 Sep 1926 Commandement du IV.Bataillon de Défense Côtière puis du IV.Bataillon d'Artillerie de Marine jusqu'au 26 Sept. 1927
29 Sep 1927-27 Sep 1929 Commandant en Second du cuirassé Schleswig-Holstein, nommé Fregattenkapitän le 1 Dec 1928.
27 Sep 1929 - 25 Sep 1930 Commandant du of the II. Bataillon d'Artillerie de Marine
29 Sep 1930 - 27 Sep 1934 Commandant la forteresse de Pillau,  promu Kapitän zur See le 1.10.1930

Kriegsmarine

1 Oct 1934 - 18 Mar 1940 nommé Officier Territorial à compter du 5 Mars 1935, chef de la Bibliothèque Navale de la Baltique puis Commandant de l'ïle de Rügen
19 Mar 1940 - 26 Jun 1940 Commandant de la Forteresse de Poméranie avec commission temporaire de Konteradmiral à compter du 1.6.1940

27 Jun 1940-31 Août 1942 Commandant de la Baltique orientale et de la forteresse de Gotenhafen. Réactivé avec le grade de Konteradmiral à partir du 1.1.1941
31 Août 1942 il prend sa retraite et est mis à disposition de la Kriegsmarine sans mobilisation jusqu'au 31 mai 1943 date à laquelle il prend sa retraite définitive.
Lors de l'avance des troupes soviétiques en 1945, il est capturé et envoyé dans le camp d'internement Vladimir à une centaine de kms au NE de Moscou. C'est là qu'il décède le 27 juillet 1954 à l'âge de 69 ans après neuf années de captivité injustifiée.

Décorations

Croix de Fer 1e et 2e classe - U-Bootabzeichen Medaille